RoseXPhLORE: NGS balstīta fitopatogēno baktēriju daudzveidības izpēte rožu dzimtas augiem ilgtspējīgiem, uz fāgiem balstītas biokontroles risinājumiem
Viesturs Dēķens
Projekta mērķis ir novērtēt baktēriju fitopatogēnu daudzveidību, kas ietekmē Rosacea augus Latvijā trīs augšanas sezonu laikā, vienlaikus izolējot un raksturojot to bakteriofāgus, tādējādi uzlabojot fitopatogēno baktēriju uzraudzības praksi un liekot pamatus lokāli pielāgotu fāgu biokontroles risinājumu izstrādei.
Projekta aktivitātes:
Identificēt un raksturot ekonomiski nozīmīgus baktēriju fitopatogēnus, kas apdraud Latvijas Rosacea augus, un izveidot visaptverošu celmu paneli, kas aptver to daudzveidību.
Izolēt un raksturot virkni dažādu bakteriofāgu, kas spēj inficēt un efektīvi lizēt identificētus fitopatogēnus baktēriju celmus no vietējiem Rosaceae audzēšanas dārziem.
Veicināt pilna genoma sekvencēšanas ieviešanu fitopatogēnu uzraudzībai, vienlaikus uzlabojot bakteriālo slimību kontroles lēmumu pieņemšanu Latvijas dārzkopībā.
Projekts integrēs jaunākās fitopatoloģijas, mikrobioloģijas, molekulārās bioloģijas un bioinformātikas zināšanas, lai sasniegtu plānotos mērķus. Projekts ievērojami palielinās zināšanas par reģionālajiem Rosacea augiem raksturīgo fitopatogēno baktēriju (un to pavadošo bakteriofāgu) vietējo izplatību.
